MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB1

Total Repeats: 1163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009926	AGA	2	6	36	41	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009926	GAA	2	6	46	51	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009926	TGC	2	6	124	129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009926	CTG	2	6	134	139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009926	TGA	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009926	ATC	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009926	ATC	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009926	AGC	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009926	AG	3	6	1449	1454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009926	TGCG	2	8	1503	1510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009926	CTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009926	ACA	2	6	2394	2399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009926	CAG	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009926	CTT	2	6	2439	2444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009926	TCT	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009926	CAG	2	6	2596	2601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009926	ATT	2	6	2627	2632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009926	TCGTGG	2	12	2633	2644	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009926	GGC	2	6	2683	2688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009926	ACACT	2	10	2689	2698	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009926	TCCCCA	2	12	2712	2723	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009926	TCAT	2	8	2736	2743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009926	GA	3	6	3323	3328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009926	GAA	2	6	3901	3906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009926	TGG	2	6	3914	3919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009926	GAG	2	6	3947	3952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009926	GAA	2	6	3965	3970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009926	TGG	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009926	ACA	2	6	4042	4047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009926	ACC	2	6	4715	4720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_009926	GCA	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009926	TCC	2	6	4852	4857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009926	TTGA	2	8	4868	4875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009926	T	6	6	4884	4889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009926	GA	3	6	4890	4895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009926	A	6	6	5018	5023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009926	GAAAC	2	10	5444	5453	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009926	TGG	2	6	5472	5477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009926	AGC	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009926	CAG	2	6	5943	5948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009926	TTAG	2	8	5960	5967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009926	ATA	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009926	TGT	2	6	6064	6069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009926	AGG	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009926	GAA	2	6	6670	6675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009926	A	6	6	6694	6699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009926	TAT	2	6	8630	8635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009926	T	6	6	11074	11079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009926	CA	3	6	11109	11114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009926	TTC	2	6	11167	11172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009926	GTC	2	6	11219	11224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009926	TGGT	2	8	11235	11242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009926	GAT	2	6	13255	13260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009926	T	6	6	14571	14576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009926	AT	3	6	14580	14585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009926	AT	3	6	14613	14618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009926	TAA	3	9	14638	14646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009926	TAG	2	6	14685	14690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009926	TAT	2	6	18057	18062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009926	GCT	2	6	18109	18114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009926	AC	3	6	18115	18120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009926	GAC	2	6	18187	18192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009926	CTT	2	6	18220	18225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009926	T	7	7	18266	18272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009926	CATC	2	8	18273	18280	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009926	AGA	2	6	18310	18315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009926	T	7	7	18463	18469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009926	TA	3	6	18482	18487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009926	ACT	2	6	18780	18785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009926	TCA	2	6	18865	18870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009926	GTT	2	6	18912	18917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009926	AGA	2	6	22760	22765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009926	GGA	2	6	22770	22775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009926	AAG	2	6	22801	22806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009926	TTGC	2	8	22964	22971	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009926	CAA	2	6	23029	23034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009926	GAG	2	6	25547	25552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009926	AGG	2	6	25575	25580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009926	GACAA	2	10	25583	25592	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009926	CCT	2	6	33369	33374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009926	AGT	2	6	33949	33954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009926	GAG	2	6	34798	34803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009926	GTT	2	6	34834	34839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009926	AG	4	8	36073	36080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009926	TTG	2	6	36098	36103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009926	ATT	2	6	36110	36115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009926	CT	3	6	36130	36135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009926	CAGG	2	8	36706	36713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009926	GTA	2	6	36795	36800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009926	A	6	6	36808	36813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009926	GGAGT	2	10	36875	36884	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009926	GAAA	2	8	36891	36898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009926	CAA	2	6	36926	36931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009926	AAT	2	6	39215	39220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009926	AAT	2	6	39257	39262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009926	CATA	2	8	39321	39328	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009926	TTA	2	6	39441	39446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009926	A	8	8	39451	39458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009926	AAT	2	6	39556	39561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009926	AAT	2	6	39634	39639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009926	AAT	2	6	39712	39717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009926	AAT	2	6	39790	39795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009926	AAT	2	6	39868	39873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009926	AAT	2	6	39933	39938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009926	CTC	2	6	42079	42084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_009926	AAT	2	6	42110	42115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009926	ATT	2	6	42117	42122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009926	ACA	3	9	43358	43366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009926	TAA	2	6	43401	43406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009926	T	6	6	44066	44071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009926	CTA	2	6	44073	44078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009926	AAT	2	6	44095	44100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009926	AGA	2	6	44142	44147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009926	A	7	7	44276	44282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009926	T	6	6	44367	44372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009926	AT	3	6	44376	44381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009926	TCC	2	6	44382	44387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009926	GAA	2	6	47002	47007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009926	TAAA	2	8	47020	47027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009926	AAT	2	6	47034	47039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009926	TAT	2	6	47060	47065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009926	TAT	2	6	47813	47818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009926	TA	3	6	47862	47867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009926	AAT	2	6	47897	47902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009926	ATA	2	6	47989	47994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009926	TA	3	6	47993	47998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009926	CTAA	2	8	48017	48024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009926	A	6	6	48029	48034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009926	ATGT	2	8	48057	48064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009926	TTA	2	6	48114	48119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009926	ATT	2	6	48122	48127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009926	T	6	6	48126	48131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009926	CAA	2	6	48203	48208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009926	TTA	2	6	48220	48225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009926	ATT	2	6	48251	48256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009926	ATTT	2	8	50075	50082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009926	TTC	2	6	50104	50109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009926	GAA	2	6	50113	50118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009926	CAT	2	6	50147	50152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009926	AT	3	6	50198	50203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009926	AAG	2	6	50235	50240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009926	GAA	2	6	50254	50259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009926	ATCT	2	8	50289	50296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009926	ATA	2	6	51023	51028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009926	CGA	2	6	52727	52732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009926	AAGA	2	8	52740	52747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009926	AT	3	6	52837	52842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009926	GCA	2	6	52904	52909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_009926	TGA	2	6	53418	53423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009926	ATT	2	6	53754	53759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_009926	ATT	2	6	54727	54732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_009926	AATA	2	8	92054	92061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_009926	AGC	2	6	92120	92125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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296	NC_009926	GTG	2	6	92145	92150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_009926	TCT	2	6	116462	116467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_009926	A	6	6	116468	116473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_009926	CT	4	8	118077	118084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
416	NC_009926	GAT	2	6	118090	118095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
417	NC_009926	TTA	2	6	118123	118128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_009926	AAT	2	6	118151	118156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_009926	AG	3	6	120040	120045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
420	NC_009926	AC	3	6	120148	120153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
421	NC_009926	TTTA	2	8	120159	120166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_009926	AATA	3	12	120176	120187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_009926	TA	3	6	120186	120191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_009926	TAC	2	6	120338	120343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_009926	TGG	2	6	120433	120438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
426	NC_009926	CTG	2	6	120481	120486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_009926	CTG	2	6	120522	120527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_009926	TACT	2	8	120576	120583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
429	NC_009926	T	6	6	120628	120633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_009926	TCA	2	6	120674	120679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_009926	CTA	3	9	120747	120755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_009926	TAA	2	6	120764	120769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_009926	A	7	7	121304	121310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_009926	ATA	2	6	129659	129664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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